Das "Problem" hat smatbohn schon angesprochen:
Wichtige .exe Dateien solltest du auf eine andere Partition oder externe Festplatte verschieben; für den Fall, dass du das Programm irgendwann einmal neu installieren musst und es z.B. ein kostenpflichtiger Download war. Von allen gängigen kostenlosen Tools wie Firefox, Avira Free, CCleaner, usw. kannst du ruhigen gewissens die .exe Dateien einfach löschen. An diese kommt man immer wieder.